Z uwagi na prowadzone tu liczne badania naukowe oraz potrzebę odtworzenia znacznej części drzewostanu rezerwat jest ogrodzony i zamknięty dla ruchu turystycznego z wyjątkiem dwóch ścieżek dydaktycznych.

Na terenie dzielnicy znajduje się również Warszawski Obszar Chronionego Krajobrazu z rezerwatem znanym pod nazwą Wyspy Zawadowskie
obejmujący swoim zasięgiem wyspy, piaszczyste łachy oraz wody płynące rzeki Wisły.

Na uwagę zasługuje Park im. Matki Mojej, powstały w latach wojny. Posadzony został przez słuchaczy konspiracyjnej podchorążówki, którzy pracowali tutaj podczas zalesień.

Do ważnych zasobów naturalnych należy sieć hydrologiczna, którą stanowią rzeka Wisła, płynąca na tym obszarze w szerokiej rozległej dolinie o urwistych krawędziach, które tworzą malownicze skarpy, 62-kilometrowa sieć kanałów i rowów melioracyjnych oraz bezodpdpływowe jeziora torfowe.
Objęta jest również ochroną Wojewódzkiego Konserwatora Przyrody znaczna liczba pomników przyrody, wśród nich 62 dęby, 21 kasztanowców, 7 sosen, 2 lipy i pojedyńcze okazy jałowca, klonu wiązu, jarząbu i in.

Obszar dzielnicy Wawer pokryty jest siecią oznakowanych szlaków turystyki pieszej, prowadzących przez urocze i zróżnicowane pod względem ukształtowania tereny. Szlaki turystyczne umożliwiają dowolne układanie wycieczek o różnej długości i tematyce: Szlak Lasów Wawerskich, Szlak Piaszczysta Perć, Szlak Na Przedpolach Stolicy, Szlak Wydmowy i Szlak Falenicki. Ścieżki piesze wraz ze ścieżkami rowerowymi są doskonałym miejscem do odpoczynku i rekreacji.

Na terenie dzielnicy znajduje się również jeden z najciekawszych i najcenniejszych terenów prawobrzeżnej Warszawy Zakole Wawerskie Stanowi najlepiej zachowane, największe rozszerzenie doliny zalewowej Wisły z mozaiką łąk, trzcinowisk oraz lasów łęgowych.

Jest miejscem bytowania 126 gatunków ptaków oraz m.in. 6 przedstawicieli herpetofauny.